用于植物高效基因激活的新的和改进的 CRISPR 3.0 系统

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CRISPR 插图。图片来源:美国国立卫生研究院

多重基因激活系统的激活能力是当前 CRISPR 技术的 4 到 6 倍,一次同时激活多达 7 个基因。

自然植物上发表的新研究中 , 马里兰大学 (UMD) 植物科学副教授齐一平介绍了一种新的改进的植物 CRISPR 3.0 系统,专注于基因激活而不是传统的基因编辑。这个第三代CRISPR系统专注于多重基因激活,这意味着它可以同时增强多个基因的功能。

据研究人员称,该系统的激活能力是当前最先进的 CRISPR 技术的 4 到 6 倍,同时展示了多达 7 个基因的高精度和高效率。虽然 CRISPR 因其可以剔除不良基因的基因编辑能力而广为人知,但激活基因以获得功能对于为未来创造更好的植物和作物至关重要。

“虽然我的实验室之前已经生产了用于同步基因编辑[多重编辑]的系统,但编辑主要是为了改善作物的功能损失,”齐解释说。 “但如果你仔细想想,这种策略是有限的,因为没有无穷无尽的基因可以关闭,实际上仍然可以获得有价值的东西。从逻辑上讲,这是一种非常有限的方法来设计和培育更好的性状,而植物可能已经进化为具有不同的途径、防御机制和只需要增强的性状。通过激活,你可以真正提升通路或增强现有能力,甚至实现新功能。您可以利用基因组中已经存在的功能并增强您知道有用的东西,而不是关闭事物。”

在他的新论文中,Qi 和他的团队在水稻、西红柿和拟南芥(最流行的模式植物物种,俗称芥菜)中验证了 CRISPR 3.0 系统。该团队表明,您可以同时激活多种基因,包括加快开花以加快育种过程。但这只是多重激活的众多优势之一,Qi 说。

“拥有一个更加简化的多路激活过程可以提供重大突破。例如,我们期待使用这项技术更有效地筛选基因组,寻找有助于应对气候变化和全球饥饿的基因。我们可以使用这个新系统在更大范围内设计、定制和跟踪基因激活,以筛选重要基因,这将非常有助于植物中的发现和转化科学。”

由于 CRISPR 通常被认为是可以切割 DNA 的“分子剪刀”,因此这种激活系统使用了只能结合的失活 CRISPR-Cas9。如果没有切割能力,该系统可以通过与某些 DNA 片段结合来专注于为特定的感兴趣基因招募激活蛋白。 Qi 还测试了他的 CRISPR-Cas9 的 SpRY 变体,这极大地拓宽了可靶向激活的范围,以及他最近的 CRISPR-Cas12b 系统的失活形式,以显示跨 CRISPR 系统的多功能性。这显示了扩展多重激活的巨大潜力,这可以改变基因组工程的工作方式。

“人们总是谈论如果你能培养和提升他们的天赋,个人将如何拥有潜力,”齐说。 “这项技术让我兴奋不已,因为我们正在植物中推广同样的东西——你如何提升它们的潜力,帮助植物利用其自然能力做更多事情?这就是多重​​基因激活可以做的事情,它为我们提供了许多作物育种和改良的新机会。”

参考文献:“CRISPR–Act3.0 用于植物中的高效多重基因激活”,作者:Changtian Pan、Xincheng Wu、Kasey Markel、Aimee A. Malzahn、Neil Kundagrami、Simon Sretenovic、Yingxiao Zhang、Yanhao Cheng、Patrick M. Shih 和 Yiping齐,2021 年 6 月 24 日,自然植物 .
DOI:10.1038/s41477-021-00953-7

这项工作由资助 美国国家科学基金会 ,奖项 #1758745 和 #2029889。