通过新的 DNA 测试改进了对沙门氏菌食物中毒爆发的跟踪

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沙门氏菌是革兰氏阴性、杆状、兼性厌氧菌。 Zhang 等人开发了敏感和特异的检测方法来检测不同的沙门氏菌血清型,为直接从样本中进行快速血清分型铺平了道路。图片来源:美国疾病控制和预防中心公共卫生图像库,James Archer (2019)。

据 The Journal of Molecular Diagnostics 报道,该测试可以快速、灵敏地区分沙门氏菌的亚型。

研究人员报告了一种检测不同血清型 沙门氏菌 的灵敏且特异的检测方法的开发 ,为直接从标本进行快速血清分型铺平了道路。这种对当前检测方法的改进可以在快速追踪感染源方面发挥关键作用。该报告发表在分子诊断杂志上 ,由爱思唯尔出版。

疾病控制和预防中心 (CDC) 的最新数据表明,由沙门氏菌引起的食物中毒 细菌每年在美国导致 135 万例感染、26,500 例住院治疗和 420 例死亡。在爆发期间,检测特定类型细菌的测试的速度和简单性对于公共卫生调查人员追查源头非常重要。

沙门氏菌 在临床或食品样品中可能以非常少量存在,因此需要非常灵敏的方法来检测它们。多重交叉置换扩增 (MCDA) 是一种可以快速检测极少量 DNA 的方法,并且也可以在单一恒定温度下进行,这与 PCR 等其他方法所需的温度循环形成对比。这使其非常适合简单、快速和灵敏的细菌检测测试。尽管任何沙门氏菌的 MCDA 测试 已经存在,它不区分不同的血清型,”澳大利亚新南威尔士州悉尼市新南威尔士大学生物技术与生物分子科学学院的兰瑞廷教授解释说。

研究人员针对 沙门氏菌 的七种血清型(亚型)特异性靶标中的每一种开发了 MCDA 检测方法 .所有这些检测方法都能准确检测出少至 10 个 DNA 拷贝,并且可以在大约 8 分钟内产生结果。重要的是,这些检测不需要专门的检测设备,从而简化了未来在临床或工业环境中的应用。通过将这七种血清型特异性检测与现有的物种检测相结合,沙门氏菌 检测可以简化和加速。

“这项研究中开发的分析是独一无二的,因为所使用的基因标记是根据分析数千个基因组选择的。因此,这些标记未来证明沙门氏菌 在独立于文化的诊断测试时代进行血清分型,”兰教授评论道。

沙门氏菌的传统鉴别方法 血清型包括从样本中培养细菌,然后对其进行测试以将它们分配给血清型。 MCDA 测试更快,因为它不需要首先培养细菌。相反,它可以检测到非常少量的沙门氏菌 脱氧核糖核酸。

虽然有数百种沙门氏菌 血清型,作者选择了在澳大利亚最常见的五种,它们导致超过 85% 的沙门氏菌 那个国家的感染。然而,这些血清型中至少有两种也是排名靠前的沙门氏菌 血清型,因此研究人员认为该结果适用于其他地理区域。

沙门氏菌 细菌通常生活在动物和人类的肠道中,并通过粪便排出。人类可能因摄入受污染的水或食物而感染,例如生的或未煮熟的肉类、家禽、鸡蛋或蛋制品。 沙门氏菌的可能体征和症状 中毒包括恶心、呕吐、腹部绞痛、腹泻、发烧和头痛。

参考:“五种流行的沙门氏菌的高灵敏度和特异性检测和血清分型 多重交叉置换扩增的血清型”,作者:Xiaomei Zhang、Michael Payne、Qinning Wang、Vitali Sintchenko 和 Ruiting Lan,2020 年 4 月 28 日,Journal of Molecular Diagnostics .
DOI:10.1016/j.jmoldx.2020.02.006